L’IE Sant Joan de les Abadesses consta de dos edificis, herència dels dos centres que es van unir per a formar l’institut escola.
Infantil i primària s’imparteix a l’antiga escola Mestre Andreu.
L’ensenyament secundari obligatori ja s’imparteix a l’edifici nou, a la Rambla Bernat Guillem de Samassó.