El nom de l’escola prové del violinista Gonçal Comellas nascut a Avinyonet de Puigventós l’any 1945, que ha estat considerat per veus expertes com el millor violinista de la seva època. Tot i rebre el nom d’un artista contemporani, els orígens de l’Escola es remunten als anys 30. La construcció de l’escola data del 1926 i es tracta d’un edifici de planta baixa amb teulada a dos vessants, construïts en dues parts iguals i simètriques unides longitudinalment per un porxo.

El curs 90-91 es va constituir oficialment la ZER La Garriga, que comptava amb les escoles de Cistella, Vilanant i Avinyonet de Puigventós. El pas del temps va fer que anés augmentant gradualment el nombre d’alumnes i això va permetre que l’Escola Gonçal Comellas sortís oficialment de la ZER. El curs 2011-12 vam iniciar una nova etapa com a escola única. El curs 16-17 l’escola va passar a ser una escola rural cíclica amb 8 grups.