L’escola La Magnòlia forma part de l’Hospital Sant Joan de Déu de Barcelona, aquest, forma part de l’Orde Hospitalà ria de Sant Joan de Déu. L’Orde Hospitalà ria té els seus orÃgens a l’any 1586, essent gestionada i assistida per la congregació dels Germans de Sant Joan de Déu sent l’hospitalitat la seva principal fortalesa.
L’Escola té els seus inicis al 1881 on els germans de l’Orde eren els que oferien classes de música. El 1908 es va començar l’atenció educativa grà cies al treball voluntari i altruista de persones vinculades a l’Hospital.
El 1967 l’Escola passa a ser reconeguda pel Ministerio de Educación y Ciencia el qual destina un professor i dues professores per atendre-la.
El 1991 es signa el conveni de col·laboració entre el Departament d’Educació de la Generalitat de Catalunya i l’Hospital, aquest consolida la continuïtat i sostenibilitat de les unitats educatives hospitalà ries.
